La obsidiana de Milos era un producto ya en Hace 15.000 años. La posición de Milos, entre la Grecia continental y Creta, y su posesión de obsidiana, lo convirtieron en un importante centro de la civilización temprana del Egeo. Milos perdió su importancia en la fabricación de armas cuando el bronce se convirtió en el material preferido para la fabricación de armas.
In historical times, the island was occupied by Dorians from Laconia. In the 6th century BC, it again produced a remarkable series of vases, of large size, with mythological subjects and orientalizing ornamentation, and also a series of terra-cotta reliefs.
Durante la segunda fase de la Guerra del Peloponeso, en 416 a. C., Atenas atacó Melos, con un ejército de más de 3.000 soldados, por negarse a rendir tributo y negarse a unirse. La alianza de Atenas contra Esparta. Los atenienses ejecutaron a todos los hombres adultos que capturaron y vendieron a las mujeres y a los niños como esclavos.
Más tarde, Milos siguió el destino de las otras islas Cícladas, sometidas a los macedonios, los romanos y luego los bizantinos. En los primeros tiempos cristianos había en Milos varios residentes judíos y por eso el cristianismo se extendió con bastante rapidez. Durante el período franco, Marco Sanudo se apoderó de Milos y en 1207 lo unió al ducado de Naxos. En 1537, Hayredin Barbarroja, uno de los mayores piratas de todos los tiempos, como jefe de la flota turca, saqueó y destruyó la mayoría de las islas del Egeo, pero Milos se salvó gracias a su furia destructiva. Desde 1566 Milos pasó de los venecianos a los turcos. Durante toda la ocupación turca, fue base de piratas.
Since 1830, according to the London Protocol, Milos, as all Cyclades islands, were included in the newly established Greek state.
El 9 de mayo de 1941, la ocupación alemana se impuso en la isla, a modo de excepción, en relación con las demás islas de las Cícladas, que se unieron a la zona de ocupación italiana.
